Hay poco que ver del interior del Templo de Khnum, pero una gran puerta de entrada cuadrada de granito es una de las pocas estructuras que se conservan. Durante las últimas temporadas de excavación, la Misión germano-suiza a Elefantina, dirigida por C von Pilgrim, ha estado investigando el área alrededor de los restos del Templo de Khnum del Imperio Nuevo. Recientemente han descubierto más del plano del templo, proporcionando detalles de la ubicación de los pilones, el patio con columnas y el patio delantero, así como una posible sala de fiestas de Amenhotep II.

Más al norte, detrás del edificio del museo, se encuentra un pequeño templo restaurado de Satis, el consorte de Khnum, construido en la época de Hatshepsut y Tuthmose III. La reconstrucción del Instituto Arqueológico Alemán se ha realizado con delicadeza, con los pocos relieves complementados con elementos dibujados. El templo fue construido sobre restos del Reino Medio debajo de diferentes niveles de piso y también un templo de la Dinastía VI. La última estructura que surgió de las excavaciones en el Templo Satis es un santuario de la Dinastía Temprana que se puede ver en un área similar a una cripta debajo del templo reconstruido, y este debe ser uno de los primeros templos que quedan en Egipto.